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Exonuclease III

簡要描述:

Exonuclease III公司正在出售的產品:人T淋巴細胞白血病細胞 磷化p38MAPK封閉多肽 巨細胞病毒PCR檢測試劑盒 大鼠透明質結合蛋白(HABP)ELISA Kit 土壤銨態氮活性比色法檢測試劑盒 速生短桿菌 原鈣粘附蛋白α9抗體

更新時間:2024-01-14

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Exonuclease III

公司產品僅供科研研究使用、不得用于臨床診斷!

描述: 核酸外切酶 III 來源于 E.coli,具有 3′-5′外切酶活性,它作用于雙鏈 DNA,從 3′ OH 末端方向逐步切去單核苷酸;每次酶與底物結合催化,只有幾個核苷酸被除掉,從而在 DNA 分子群內產生漸進缺失。該酶的最佳底物為平末端、5′突出末端雙鏈 DNA 分子,但也可作用于雙鏈 DNA 的缺刻處,從 3′降解 DNA 分子,釋放 5′單核苷酸。對于 3′突出末端,尤其是多于 4nt 的幾乎不切割, 亦不能切割硫代磷酰脂鍵。核酸外切酶 III 的活性部分依賴螺旋結構,并根據序列的不同 而有差異(C>A=T>G)。另外,核酸外切酶 III 還具有脫嘌呤/嘧啶-核酸內切酶活性、RnaseH 活性和 3′磷酸酶活性。

活性定義:50 μl 反應體系中,37℃ 條件下,30 分鐘
催化 E.coli DNA 產生 1 nmol 酸可溶性產物所需要的量定義為一個活性單位。
應用: 非定向巢式缺失定點突變鏈特異性探針的制備
制備用于雙脫氧測序的單鏈底模板
熱失活:70°C,20min。
1X Exonuclease III Buffer: 10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10
mM MgCl2,1 mM DTT。
酶儲存液:50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 50 mM KCl, 1 mM
DTT, 25% Glycerol.
儲存:置于-20°C 可保存 2 年,避免反復凍融。

貨號

產品名稱

規格

A-PJ1126

Exonuclease III

5000U

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PCR 反應需要使用哪些試劑和設備?

試劑:
模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產物;
設備:
PCR儀:用于控制反應溫度,保證PCR反應時不同溫度環節的嚴格控制;電泳槽:用于分離PCR擴增產物;核酸提取儀:從組織樣本中全自動提取核酸。  這些試劑和設備在PCR分子生物學技術中均是,只有在有序齊全的基礎上,才能進行PCR反應并得出準確結果。

PCR相關基礎實驗:

PCR反應基本步驟一般的聚合酶鏈式反應由20到35個循環組成,每個循環包括以下3個步驟:

一、變性:

利用高溫(93-98℃)使雙鏈DNA分離。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷。在第一個循環之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物分離,僅以單鏈形式存在。該步驟時間1-2分鐘,接下來PCR儀就控制溫度進入循環階段。

二、退火或稱接合,復性:

在DNA雙鏈分離后,降低溫度使得引物可以結合于單鏈DNA上。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導致引物不與模板結合或者錯誤地結合。該步驟時間1-2分鐘。

三、延伸:

DNA聚合酶由降溫時結合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度。傳統的Taq估計合成1000bp/min、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業公司生產的融合型聚合酶僅需約10-15秒。

PCR反應條件優化:

1、變性溫度和時間:

保證模板DNA解鏈是保證整個PCR擴增成功的關鍵。加熱90~95°C, 30~60s,再復雜的DNA 分子也可變性為單鏈。溫度過高或高溫持續時間過長,可對Taq酶活性和dNTP分子造成損害。

2、復性溫度和時間:

PCR擴增特異性取決于復性過程中引物與模板的結合。復性溫度越高,產物特異性越高。復性溫度越低,產物特異性越低。需根據引物的Tm值具體設定。

3、延伸溫度和時間:

一般位于Taq酶最適作用溫度70~75°C之間。引物小于16個核苷酸時,過高的延伸溫度不利于引物與模板的結合,可以緩慢升溫到70~75°C。延伸反應時間,可根據待擴增片段的長度而定,小于1kb, 1min足夠;大于1kb需加長延伸時間。Taq酶可根據1kb/min增加時間。這里需要注意,延伸時間過長可能出現非特異擴增。因此需要設置恰到好處的延伸時間。

4、循環數:

其他參數選定后,PCR循環次數主要取決于模板DNA的濃度。理論上說20?25次循環后,PCR產物的積累即可達到最大值,實際操作中由于每步反應的產率不可能達到100%,因此不管模板濃度是多少,20~30次是比較合理的循環次數。循環次數越多,非特異擴增增加。

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